SeqCap EZ Human Exome Library v3.0

製品番号	製品名	反応数／キット	希望販売価格(税抜)
6465684	SeqCap EZ Human Exome Library v3.0, 4 reactions	4	¥450,000 キャンペーン中！¥360,000 2012年8月31日まで
6465692	SeqCap EZ Human Exome Library v3.0, 48 reactions	48	¥2,700,000 キャンペーン中！¥1,620,000 2012年8月31日まで

 

■　特徴　：最も網羅的にエクソームをカバー！

SeqCap EZ Human Exome Library v3.0 は、HG19 を元にヒト全エクソン合計 64 Mb がカバーされるよう設計されています。CCDS (April 2011) の99.8 ％、RefSeq （June 2011） の 98.36 ％、miRBase （v15） の98.67 ％、Ensembl (v63) の 98.99 ％の他、Vega (v42) の97%、Gencode (v3c) の97% がカバーされるよう設計され、他社製品と比較して最も網羅的にエクソームをカバーしています。本製品のターゲット領域は、SeqCap EZ Human Exome Library v2.0のターゲット領域の全てを含んでいます。

 

■　特徴　：効率化を追求したプローブ設計！

本製品は初期バージョンである v1.0 、次バージョンである v2.0 からさらに改良を重ねて開発された製品です。 v1.0 ではシークエンスリードが均一的に得られるような ＮｉｍｂｌｅＧｅｎ 独自の最適化アルゴリズムが採用され、v2.0 では実験結果に基づきプローブが選抜・再配分されました。v3.0 (本製品) ではプローブの再配分を更に進め、より均一的なシークエンシングが得られるよう設計されています。

この結果、SeqCap EZ Human Exome Library v2.0と比較してターゲットサイズは44 Mb から 64 Mbと大幅に増強していますが、シークエンシング必要量を微増に抑えることに成功しています。実際、マップされたリードデータの約 4Gb から、ターゲット領域の 90 % の塩基が 10x 以上でカバーされるデータが得られています。

 

 

■　ターゲット領域の確認

SeqCap EZ Human Exome Library v3.0 のターゲット領域をご確認いただくには、 こちら から
・　SeqCap_EZ_Exome_v3_primary.bed
・　SeqCap_EZ_Exome_v3_capture.bed
・　SeqCap_EZ_Exome_v3.gff
の3つのファイルを圧縮したものをダウンロードすることができます。

 

■　デモデータ・パフォーマンスデータ

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■　ランニングコストを抑えた効率的なシークエンシング 「マルチプレックス　キャプチャー」　について

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■　関連リンク先

・　SeqCap EZ の 技術概要 のページへ

・　プロトコール、アプリケーションノート、テクニカルノート等：　ユーザーズガイド等 のページへ
                                                                （実験に必要な機器・試薬は各ユーザーズガイドでご確認ください）

・　NimbleGen SeqCap EZ Hybridization and Wash Kit

・　SeqCap EZ と オートメーションシステム についてのページへ

 

■　注

※　価格は予定なしに変更することがございます。
※　納品後、-20℃で保管してください。
※　凍結融解を繰り返さないようにしてください。
　　（最初に使用する際に一回分ずつに分注して使用しない分を-20℃で保存してください）
※　本製品添付のプロトコールは、Illumina社シークエンサー（HiSeq1000、HiSeq2000、GAIIx）とロシュ454 GS FLXに対応しています。
※　DNAライブラリ調製キット、ハイブリダイゼーションバッファーキット、ハイブリダイゼーション用ブロッキングオリゴ等を別途ご購入頂く必要がございます。