NimbleScan Software

製品名	製品番号	梱包サイズ	税抜希望販売価格
NimbleScan v2.6 Software	5933315	個人ライセンス	¥192,000
	5933331	サイトライセンス	¥960,000
	5933358	個人ライセンスバージョンアップ費用	¥80,000
	5933366	サイトライセンスバージョンアップ費用	¥300,000

 

■　製品概要

NimbeScan Software (ニンブルスキャン ソフトウェア) はNimbleGenマイクロアレイのスキャニング画像データ（TIFF)から各フィーチャーのシグナル値を数値化、アプリケーションごとのデータ解析機能をもつソフトウェアです。
NimbleGen MS200 マイクロアレイスキャナには本ソフトウェアが3ライセンス付属しています。

 

■　対応アプリケーション

NimbleScan v2.6 では、各フィーチャーのシグナル強度の数値化後、アプリケーションに最適化された解析を行うことが可能です。（*のアプリケーションではフィーチャーエクストラクション機能のみを使用します）

• CGH/CNVアレイ解析
• ChIPアレイ解析
• メチレーションアレイ解析
• 遺伝子発現解析
• 微生物ゲノム解析 *

 

■　特徴

NimbleScan ソフトウェアは、v2.6 へアップグレードした際にいくつかの改善を行っています：

• CGH/CNVアレイ解析で使用するsegMNT アルゴリズムを、より正確な解析が行えるよう改善しています。
• NimbleGen MS 200 マイクロアレイスキャナによる2 µm 画像のグリッディングとアライメントのパフォーマンスが強化されました。
• それぞれのアプリケーションに対応した一次データ解析において、様々な解析設定パラメーターを記録したセッティングファイルが保存されるようになりました。
• 30日間のトライアル版から正規ライセンス版に移行する場合に再インストールは必要ありません。ソフトウェアの起動時のメッセージボックスにライセンスキーを入力してください。

 

■　システム条件

NimbleScan 2.6 ソフトウェアは下表の全てのオペレーションシステムのPCにインストールすることができますが、1x2.1 M アレイの解析は一部のOS環境でのみサポートされています。

OS	1x2.1M	3x720K	12x135K	1x385K	4x72K
Windows XP, Windows Vista, or Windows 7* (32-bit)	×	○	○	○	○
Windows Vista or Windows 7* (64-bit)	○	○	○	○	○
Linux Kernel 2.5 or 2.6 (32-bit)	×	○	○	○	○
Linux Kernel 2.6 (64-bit)	○	○	○	○	○
Mac OS 10.5 or 10.6 (64-bit) (Intel processor only)	○	○	○	○	○

* Windows 7 での動作上での問題については下項をご参照ください。

 

	1x385K arrays 4x72K arrays 3x720K arrays 6x315K arrays 12x135K arrays	1x385K arrays 4x72K arrays 3x720K arrays 6x315K arrays 12x135K arrays 1x2.1M arrays
Windows	Microsoft Windows XP x32, Windows Vista x32, or Windows 7 x32	Microsoft Windows Vista x64 or Windows 7 x64
Linux	Linux Kernel 2.5 or 2.6 on Intel	Linux Kernel 2.6 (64-bit)
Mac OS		Mac OS 10.5 or 10.6 on Intel with Java 1.6 or later 2
プロセッサ	1GHz	3GHz, 64-bit
メモリ	2GB	8 GB 1
インストールに必要な ハードディスク空き容量	120MB	120MB
モニタ	XVGA 1024x768 with 16-bit colors 3	XVGA 1024x768 with 16-bit colors
キーボード＆マウス	Standard	Standard

1： 2-μmの解像度でのスキャニングを実施する場合にはマイクロアレイフォーマットに関わらず、3 GHz, 64-bitプロセッサと、8 GBメモリ以上のシステムをご利用ください。
2： Mac OSにインストールするには、Apple Rosetta packageが必要です。
3： Windows 7にインストールする場合には、1158x870 ピクセル以上のモニタをご利用ください。

 

■　Windows 7での動作につきまして

Windows 7 に NimbleScan ソフトウェアをインストールしたり使用したりする際には、下記の問題があることが確認されています。

• インストール中に“This program might not have installed correctly.”という警告画面が表示されます。これはNimbleScan v2.6ソフトウェアのインストールに特異的な警告ではありません（様々な他のソフトウェアをインストールする際にも同様のメッセージが表示されます）ので、このメッセージを無視してインストールを進めてください。
• OpenやSaveなどのダイアログボックスで、ドロップダウンメニュー、このドロップダウンメニューの右のナビゲーションボタンが正しく表示されない場合があります。ご不便をお掛けしますが、ファイルパスを手入力していただくことでファイルの選択等を行ってください。

 

■　30日間使用可能なライアルバージョンをダウンロード！

NimbleScan ソフトウェアは30日間無料でお試しいただけます。インストールするPCのOSに対応したインストーラーをダウンロードしてください。

OS	ダウンロード	方法
Windows XP, Windows Vista, or Windows 7* (32-bit)	<ダウンロード>	1．ダウンロードファイルを解凍してください。 2．nimblescan_2_6_install.exeをダブルクリックしてください。
Windows Vista or Windows 7* (64-bit)	<ダウンロード>	1．ダウンロードファイルを解凍してください。 2．nimblescan_2_6_install.exeをダブルクリックしてください。
Linux Kernel 2.5 or 2.6 (32-bit)	<ダウンロード>	1．ダウンロードファイルを解凍してください。 2．インストーラーをローカルディレクトリに保存した後、shell を開き、ディレクトリを移動させます ( cd )。 3．プロンプトsh ./nimblescan_2_6_install.binを入力してください。
Linux Kernel 2.6 (64-bit)	<ダウンロード>	1．ダウンロードファイルを解凍してください。 2．インストーラーをローカルディレクトリに保存した後、shell を開き、ディレクトリを移動させます ( cd )。 3．プロンプトsh ./nimblescan_2_6_install.binを入力してください。
Mac OS 10.5 or 10.6 (64-bit) (Intel processor only)	<ダウンロード>	1．ダウンロードファイルを解凍してください。 2．nimblescan_2_6_install.appをダブルクリックしてください。

* Windows 7 での動作上での問題については上項をご参照ください。

NimbleScan 2.6をインストール後に初めて起動すると、ライセンス認証のウィンドウが表示されます。ライセンスをお持ちの方は「Enter Key」ボタンをクリックしてライセンスコード番号を入力してください。ライセンスコードが認識されると次回以降の起動時にはこのウィンドウは表示されません。デモ版のご利用を希望される方は「30-day trial」ボタンをクリックしてください。

 

■　ユーザーズガイド等

• NimbleScan Software User’s Guide: Version 2.6
  ユーザーズガイド (PDF Format 5.8MB)
   
• NimbleScan v2.6 Example Mouse Data Files
  NimbleScanソフトウェアの使い方をマスターするためのチュートリアルデータ (ZIP Format 32MB)
   
• NimbleScan v2.6 Software
  Release Notes (PDF Format 112KB)