DEVA Software

 

製品名	製品番号	梱包サイズ	税抜希望販売価格
DEVA Software	6264859	個人ライセンス	<ダウンロード> *

 * 無償でダウンロードいただけます。上記リンクから英語ページに移動していただき "Download DEVA" をクリックしてご所属等を入力すると、ダウンロードページが開きます。

 

■　製品概要

DEVA Software (ディーバ ソフトウェア) は、ハンズオン時間を短縮して快適な解析を実施するための、

1. 自動画像インポート
2. 自動フィーチャーエクストラクション（画像データの数値化）
3. 自動ワークフロー解析（一次データ解析）
4. 視覚化機能

を備えた解析ソフトウェアです。デザインファイルをアップロードして解析ワークフローを設定しておくと、指定したディレクトリにスキャニング画像が検出されると自動的に画像データ解析プロセスと解析ワークフローが開始し、解析データは直ぐにゲノムビューワーで確認することができます。

 

■　対応アプリケーション

DEVAは、NimbleGenマイクロアレイでの下記のアプリケーションのデータ解析が可能です。

• CGH/CNVアレイ解析
• NEW! CGH/LOHアレイ解析
• NEW! AccuSNPアレイ解析
• ChIPアレイ解析
• メチレーションアレイ解析
• 遺伝子発現解析

 

■　特徴

• NimbleGenアレイ実験で解析・視覚化を1つのソフトウェア上で実施します。
• 自動画像データ解析プロセシング、自動データ解析ワークフローで手間を大きく軽減できます。
• CGHデータの視覚化ツールが追加されました。共通領域の抽出に活用できます。
• データの近傍のコード情報の検索機能が追加されました。
• 遺伝子発現解析（1色法）でのデータの自動抽出機能が追加され、RMAノーマライゼーションも可能になりました。
• NEW! CGH/LOH、AccuSNPアレイ利用時に使用できる解析ワークフローが追加されました。 

 

■　システム条件

DEVA v1.2 ソフトウェアは、Windows 7 (64-bit)、Windows 7 (32-bit)、Windows XP (32-bit)で動作します。

	Microsoft Windows XP x32 or Windows 7 x32	Microsoft Windows 7 x64
プロセッサ	1.5 GHz, 32-bit, Intel Processor	2 GHz, 64-bit, Intel Processor 4
メモリ	4 GB	8 ～ 10 GB 2
インストールに必要な ハードディスク空き容量	1 GB	1 GB
データ解析の実施に推奨する ハードディスク空き容量	20 GB	100 GB
モニタ	XVGA with 1024 x 768 resolution1	XVGA with 1400 x 1050 resolution
キーボード＆マウス	Standard	Standard
適用可能なアレイフォーマット	3x720K アレイ 6x315K アレイ 12x135K アレイ 1x385K アレイ 4x72K アレイ	1x4.2M アレイ2 3x1.4M アレイ 6x630K アレイ 12x270K アレイ 1x2.1M アレイ3 3x720K アレイ 6x315K アレイ 12x135K アレイ 1x385K アレイ 4x72K アレイ

1： Windows 7の場合にはサポート対象の最少モニタ解像度は 1158x870 ピクセルです。
2： 1x4.2Mアレイの2 μm の解像度でのスキャニング画像を解析する場合には、2 GHz, 64-bit プロセッサ, 10GB RAM 以上のシステムが必要です。
3： 1x2.1Mアレイの2 μm の解像度でのスキャニング画像を解析する場合いは、2 GHz, 64-bit プロセッサ, 8GB RAM 以上のシステムが必要です。
4： DEVA v1.1にアップグレードする際に推奨スペックが変更されました。

 

■　チュートリアル

DEVAソフトウェアの使用方法を簡単にマスターしていただくために、操作練習用のデータをご用意しています。操作方法につきましては、ユーザーズガイド Chapter 2. の DEVA Software Tutorial 章をご参照ください。 
 

• DEVA Tutorial Files: Version 1.0
  チュートリアル用データ (ZIP Format 900MB）
  ※ファイルサイズが非常に大きいため、ダウンロードに時間が掛かる場合があります)

 

■　ユーザーズガイド等

• NEW! DEVA Software User’s Guide: Version 1.2
  ユーザーズガイド (PDF Format 8.7MB)
  ※ v1.2 に対応しています
   
• NEW! DEVA Software Release Notes: version 1.2
  Release Notes (PDF Format 132KB)
   
• Guide to Interpreting the Experimental Metrics Report: Version 3.0
  品質検査項目ガイド (PDF Format 134KB)
   
• NimbleGen DEVA Software 日本語マニュアル: (J)Ver 1.0
  ユーザーズガイド (PDF Format 2.5MB)
  ※ v1.0.2 に対応しています。v1.1、v1.2 をご利用の場合には英語版ユーザーズガイドをご参照ください。
   

 

■　（DEVA v1.0.2 版）アプリケーション別日本語簡易マニュアル

• NimbleGen Gene Expression Arrays 日本語マニュアル：(J)Ver1.1
   
• NimbleGen DNA Methylation Arrays 日本語マニュアル：(J)Ver1.1
   

 

■　アクセサリファイル

遺伝子発現解析用アレイを解析する場合には、アレイに付属のデザインファイル以外にPOSファイルが必要になる場合がございます。下記のファイルをダウンロード・解凍し、お手元にご準備ください。 

• Expression POS File
  POSファイル (ZIP Format 1KB)