マイクロアレイフォーマット

■　Roche NimbleGenの超高密度アレイ

2011年春にHD4プラットフォームのマイクロアレイが新登場しました。NimbleGenのマイクロアレイは、1枚のスライドガラス上に合成できるプローブの種類（フィーチャーの数）によって、385Kプラットフォーム、HD2プラットフォーム、HD4プラットフォームと進化し続けています。

 ▲図　NimbleGenマイクロアレイのプラットフォーム模式図とそれぞれのアレイフォーマット

 

　　　　　　　

 ▲図　HD2プラットフォームのアレイで実際にハイブリダイゼーションを行ったスキャン画像例
CGHアレイ実験を行ったアレイスライドを NimbleGen MS200 マイクロアレイスキャナの2um解像度でスキャニングし、得られた画像のうちCy3スキャン画像をDEVA Softwareの「Fire」カラーモードで表示しています。各画像は1つのスキャン画像を異なる拡大率で見た図となり、中央付近を順次拡大しています（各画像をクリックすると別ウィンドウで拡大画像を見ることができます）。各フィーチャーはグリッドアライメント線で認識されています。

 

■　実験の精度・コストなどのニーズに合わせてアレイフォーマットをご選択下さい

〇　1x 4.2Mアレイ

	アレイ数／スライドガラス	1
	プローブ数／アレイ	4,200,000
	アレイ領域サイズ	62 mm x 14 mm
	フィーチャーサイズ	13 µm x 13 µm
	スライドガラスサイズ	1" x 3" (25 x 75 mm)

 

〇　3x 1.4Mアレイ

	アレイ数／スライドガラス	3
	プローブ数／アレイ	1,400,000
	アレイ領域サイズ	19 mm x 14 mm
	フィーチャーサイズ	13 µm x 13 µm
	スライドガラスサイズ	1" x 3" (25 x 75 mm)

 

〇　6x 630K アレイ

No image	アレイ数／スライドガラス	6
	プローブ数／アレイ	630,000
	フィーチャーサイズ	13 µm x 13 µm
	スライドガラスサイズ	1" x 3" (25 x 75 mm)

 

〇　12x 270K アレイ

	アレイ数／スライドガラス	12
	プローブ数／アレイ	270,000
	アレイ領域サイズ	8.9 mm x 6.5 mm
	フィーチャーサイズ	13 µm x 13 µm
	スライドガラスサイズ	1" x 3" (25 x 75 mm)

  

〇　1x 2.1M アレイ

	アレイ数／スライドガラス	1
	プローブ数／アレイ	2,100,000
	アレイ領域サイズ	62 mm x 14 mm
	フィーチャーサイズ	13 µm x 13 µm
	スライドガラスサイズ	1" x 3" (25 x 75 mm)

 

〇　3x 720K アレイ

	アレイ数／スライドガラス	3
	プローブ数／アレイ	720,000
	アレイ領域サイズ	19 mm x 14 mm
	フィーチャーサイズ	13 µm x 13 µm
	スライドガラスサイズ	1" x 3" (25 x 75 mm)

 

〇　12x 135K アレイ

	アレイ数／スライドガラス	12
	プローブ数／アレイ	135,000
	アレイ領域サイズ	8.9 mm x 6.5 mm
	フィーチャーサイズ	13 µm x 13 µm
	スライドガラスサイズ	1" x 3" (25 x 75 mm)

 

〇　1x 385K アレイ

	アレイ数／スライドガラス	1
	プローブ数／アレイ	385,000
	アレイ領域サイズ	817.4 mm x 13 mm
	フィーチャーサイズ	16 µm x 16 µm
	スライドガラスサイズ	1" x 3" (25 x 75 mm)

 

〇　4x 72K アレイ

	アレイ数／スライドガラス	4
	プローブ数／アレイ	72,000
	アレイ領域サイズ	87.8 mm x 5.7 mm
	フィーチャーサイズ	16 µm x 16 µm
	スライドガラスサイズ	1" x 3" (25 x 75 mm)