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DIGアプリケーションマニュアル for Filter Hyb.

ロシュ・アプライド・サイエンス

このマニュアルは、DIG(ジゴキシゲニン)などのハプテン標識を用いたサザンハイブリダイゼーション、ノーザンハイブリダイゼーション、コロニー/プラークハイブリダイゼーションを対象としたマニュアルです。プローブのラベリングから、シグナル検出までの詳細について記載しております。DIGを用いたメンブレンハイブリダイゼーションを行う際の、ご参考にして頂ければ幸いです。

また、DIGアプリケーションマニュアル for In situ ハイブリダイゼーションもご用意しておりますので、In situ ハイブリダイゼーションを行う際には、こちらもご利用下さい。

このマニュアルは、印刷物としても無償で配布しております。製本版マニュアルはこちらからご請求下さい。

<目次>

はじめに
DIGシステムと本マニュアルの紹介
第1章DIGの基礎
1. はじめに
2. DIGラベリング
2.1 DIGによるノンラジオアクティブなラベリング法の概要
2.2 PCRラベリング法、ランダムプライムドラベリング法、RNAラベリング法の比較
3. プローブのラベリング効率を評価する
3.1 直接検出アッセイの概要
3.2 PCRラベルされたプローブのゲル電気泳動による解析
4. ターゲット核酸をアガロースゲル電気泳動する
4.1 ゲルにロードするターゲット核酸の量
4.2 アガロースゲルの調製と電気泳動
5. ターゲット核酸をメンブレンへブロットトランスファーする
5.1 ブロッティングメンブレンについて
6 ターゲット核酸とプローブとのハイブリダイゼーション
6.1 ハイブリダイゼーション中でのDIGラベルされたプローブ濃度
6.2 最適なハイブリダイゼーション温度の決定
6.3 ハイブリダイゼーション用バッファーの組成
6.4 ハイブリダイゼーションの所要時間
7. ブロットをストリンジェント洗浄する
8. プローブとターゲット拡散とのハイブリッドを検出する
9. メンブレンからのプローブの剥離とリプロービング
10. DIGラベリングおよび検出実験のための設備
11. DIG製品セレクションガイド


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第2章ノンラジオアクティブなラベリングと検出の方法
1. はじめに
2. ハイブリダイゼーション用プローブのラベリングに関するテクニック
2.1 ランダムプライムドラベリングに必要な材料
2.2 PCR法によるDNAプローブのラベリング
2.3 トランスクリプションによるRNAプローブのラベリング
2.4 オリゴヌクレオチドのDIGラベリング
2.5 直接検出法によりプローブの収量を概算する
3. DIGラベルされたプローブをブロットへハイブリダイズさせるテクニック
3.1 DNAプローブのサザンブロットへのハイブリダイゼーション
3.2 RNAプローブのノーザンブロットへのハイブリダイゼーション
3.3 ブロットから最良の結果を得るために
4. ブロット上にハイブリダイズしたプローブを検出するテクニック
4.1 化学発光法によるブロット上にハイブリダイズしたプローブの検出
4.2 発色法によるブロット上にハイブリダイズしたプローブの検出
5. メンブレン上のプローブの剥離とリプロービングのテクニック
5.1 プローブを剥離させる反応に必要な材料
5.2 操作方法
6. DIGラベルされたプローブの大容量スクリーニング・アプリケーション
6.1 DIGラベルされたプローブをコロニー/プラークハイブリダイゼーションに使用する

 
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第3章その他のノンラジオアクティブアッセイ
1. はじめに
2. ノンラジオアクティブなウエスタンブロットアッセイ
2.1 アッセイの概要
2.2 ノンラジオアクティブなウエスタンブロットアッセイの代表的な実験結果
3. ノンラジオアクティブなテロメアレングスアッセイ
3.1 アッセイの概要
3.2 ノンラジオアクティブなテロメアレングスアッセイの代表的な実験結果
4. ノンラジオアクティブなRNaseプロテクションアッセイ
4.1 アッセイの概要
4.2 ノンラジオアクティブなRNaseプロテクションアッセイの代表的な実験結果
5. ノンラジオアクティブなゲルシフトアッセイ
5.1 アッセイの概要
5.2 ノンラジオアクティブなゲルシフトアッセイの代表的な実験結果
6. DIGラベルされたDNAを直接検出する
6.1 アッセイの概要
6.2 PCR DIG Labeling Mixを用いた代表的な実験結果
6.3 PCR DIG Probe Synhesis KitおよびPCR DIG Labeling Mixを用いて調製されたハイブリダイゼーションプローブの感度の比較

 
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付録
付録A DIGの基礎のまとめ
付録B DIGシステムのトラブルシューティング
付録C DIGラベリングおよび検出結果を改善するには
付録D 各種溶液の調製
付録E ご注文情報とDIGシステムの製品一覧

 
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