Tsc DNAリガーゼ- ホットなライゲーション反応!

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Tsc DNAポリメラーゼは、目的のDNAと相補的にハイブリダイズする二つの近接オリゴヌクレオチド末端を結合させるために選択される酵素です。この酵素は次の応用に適しています。

  • 目的のDNAを増幅するためのリガーゼチェインリアクション(LCR)に。
  • ミューテーション分析でのオリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ(OLA)に。
  • トリヌクレオチドリピートなどの遺伝的異常(Fragile X、ハンチントン病など)の、リピート伸展検出。
  • オーバーラッピングオリゴヌクレオチドからの遺伝子合成。

図6. OLAに基づく野生型シークエンスの検出。LDLレセプター中の野生型とS258Lミューテーション配列に対する、ビオチンおよびDIG標識オリゴヌクレオチドを持ちい、DIGに対するELISAを行った。OLAアッセイは能書通り、5μlのPCR産物と30 nMの各オリゴヌクレオチドを用いた。2μlのOLA反応液をDIG ELISAで分析した。A: ABTS溶液のみのコントロール反応; B: プローブ無しのコントロール反応; C: 野生型オリゴヌクレオチドセット(野生型とコモンオリゴヌクレオチド); D: ミュータントオリゴヌクレオチドセット(ミュータントとコモンオリゴヌクレオチド)。シークエンス検出に用いたオリゴヌクレオチドは;

  • 野生型; 5’-biotin-CCG-GGA-CTG-GTC-3’,
  • ミュータント: 5’-biotin-CCG-GGA-CTG-GTT-3’,
  • コモンオリゴヌクレオチド; 5’-p-AGA-TGA-ACC-CAT-CA-digoxigenin-3’.

T4 DNAリガーゼと異なり、Tsc DNAリガーゼは平滑末端DNA断片において検出可能な活性を持たず、至適温度条件下で4 bpと2 bpの突出末端においても最小限の活性しか示しません。またRNAにおいては活性を持ちません。クローン化されたTsc DNAリガーゼは最初、好熱性真正細菌、Thermus scodoductusより単離されました。Tsc DNAリガーゼの半減期は95℃で1時間以上です。この酵素は広い反応温度を持ち、下限は30℃付近、上限はDNA基質の融点と決定されています。またpH 7-9の色々なポリメラーゼバッファー(Taq DNAポリメラーゼやExpandTMHigh Fidelity PCRシステムなどのバッファー)中でも活性を持ちます。Tsc DNAリガーゼはT4 DNAリガーゼの代わりには使用出来ません。

製品名 製品番号 包装単位
Tsc DNA Ligase
200 units
1000 units
関連製品 製品番号 包装単位
Taq DNA polymerase,  

5 units/μl

100 units
500 units
4 x 250 units
20 x 250 units
10 x 250 units
Pwo DNA Polymerase
100 units
2x250 units
Tth DNA Polymerase
100 units
500 units
ExpandTMLong Template PCR System
100 units
500 units
2500 units
Expand High Fidelity PCR System
100 units
500 units
2500 units
PCR Fluorescein Labeling Mix
10 PCR反応
High Pure PCR Product Purification Kit
50回精製
250回精製
AP-Oligonucleotide Labeling Kit
10回反応
DIG Oligonucleotide 3’-End Labeling Kit
25回反応
DIG Oligonucleotide 5’-End Labeling Kit
10回反応
DIG Oligonucleotide Tailing Kit
25回反応

 

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