GSジュニアベンチトップシステムは、多種多様なシークエンスのアプリケーションに最適なソリューションを提供します。

de novo シークエンス

1ランでリーズナブルに微生物の全ゲノムをシークエンス可能

GSジュニアベンチトップシステムでは、バクテリア、ウイルス、菌類の全ゲノムおよびその他の小さなサイズのゲノムまたは複数のBACやプラスミドのシークエンスに最適です。ロング シングル リードのみを使うか、またはペアドエンド リードと組み合わせることで、コンティグのほとんどない高品質のde novo アセンブルが可能です。また複数の全ゲノム比較解析を行い、サンプル間の差異を識別することも可能です。提供されるポイントアンドクリックで操作可能なde novo アセンブル ソフトウェアが解析をサポートします。

ターゲット シークエンス

高感度なアンプリコン シークエンス

GS ジュニアシステムではアンプリコン（PCR産物）のウルトラディープシークスを行うことが可能です。このシステムでは、1回のランにつき平均100,000個の高品質リードが出力されるため、プールされたウイルスサンプルやヒトDNAなどのアンプリコンサンプル中における低頻度変異の検出には理想的です。ターゲット シークエンス プロジェクトにおいては、何百ものアンプリコンを対象ゲノム領域（疾病関連領域など）全域に設計し、それらをまとめてシークエンスすることが可能です。

Multiplex Identifier（MID）または「バーコード」と呼ばれるDNA配列をサンプルDNAに加えると複数サンプルを混合してシークエンス解析することが可能です。各MIDはシークエンスラン後、データ解析ソフトウェアによって認識および分離されます。これにより、高い信頼性をもって個々のシークエンスの解読結果を個別に解析することが可能です。

サンプル濃縮テクノロジーを使用したターゲット シークエンス

シークエンス キャプチャー技術によって、ゲノム中の興味のある領域だけをターゲットとしてシークエンスし、キャプチャーしたDNA領域中の変異を評価することが可能です。GSジュニアシステムは、4000万塩基以下程度のデータを必要とする小規模なシークエンス キャプチャープロジェクトに最適です。

メタゲノム解析

種の多様性の全体像を手に入れてください。

GSジュニアシステムでは、複雑な環境サンプルの多様性と代謝プロフィールの包括的な情報を得ることが可能です。100,000リードの解析により、複雑なメタゲノムでも種識別を高いパーセンテージで実現、複雑度が低い場合はより高い種識別を実現します。得られた配列情報をDNAやタンパクのデータベースと比較する際にロングリードは非常に高い特異性をもたらすため、近縁種の生物に対しても確実な割り当てが可能です。

そして、さらに…

GSジュニアシステムでは、ショットガン シークエンスおよびペアド エンドシークエンスのための分かりやすいプロトコールを提供するとともに、包括的なトランスクリプトーム解析のためのcDNAプロトコールを提供します。実証された454シークエンス テクノロジーによって、広く様々な分野やアプリケーションで、何百もの査読論文等が刊行されています。すべてのリストを見るには、ここをクリックしてください。