デスクトップで454シークエンステクノロジーのパワーをご活用ください。

GSジュニアシステムは、ロングリードのデータとコンパクトなデータ容量で効率よく解析をすることが可能です。すべてのデータ処理は、GUIベースのGS Data Analysis Softwareがインストール済みの付属のコンピュータで実行可能です。コマンドラインで操作する必要もありません。高価なハイエンド クラスターコンピュータも必要ありません。

GS Data Analysis Softwareパッケージには、アセンブル、マッピング、変異検出のための使いやすいツールが装備されています。

GS De Novo Assembler

ポイントアンドクリックで行えるゲノムとトランスクリプトーム アセンブル

• 微生物ゲノムならわずか15分、より大きなゲノムでも数時間で高品質のアセンブルが可能です。
• シングル リードのみのアセンブル、およびペアド エンド リードと組み合わせてScaffold形成が可能です。
• ソフトウェアは、cDNAシークエンスのde novo アセンブル、スプライスバリアント検出、転写アイソフォームの識別を含むトランスクリプトーム解析でのニーズに対応するようにデザインされています。
• 直感的に分かりやすいGUI、またはコマンドラインでの操作も可能です。
• データ出力: .fna（コンティグ配列、FASTAフォーマット）、.qual（Phredスコアリングに相当するスコア）、.ace（コンティグ配列の各リードのアライメント情報）、オプションとしてconsed対応ファイル出力など。

GS Reference Mapper

リ・シークエンスのための自動変異検出

• リードを任意のレファレンス ゲノムにマッピングして共通配列を生成します。
• レファレンス ゲノムと比較して迅速に高信頼度で違いを識別し、別ファイルに出力します。
• ゲノムの変異を網羅的に探索します。
• 局所的変異の検出: SNP、挿入および欠失（50塩基まで）
• 構造的変異の検出: 再構成点および領域
• データ出力: .fna（コンティグ配列、FASTAフォーマット）、.qual（ Phredスコアリングに相当するスコア）、.ace（コンティグ配列の各リードのアラインメント情報）

GS Amplicon Variant Analyzer

アンプリコン（PCR産物）サンプルからの高感度な変異検出

• レファレンス配列の有無にかかわらず、自動的にアンプリコン リードをアラインメントします。
• 大きな混合サンプルプール中から変異を識別して、頻度をレポートします。
• （レファレンスを用いて）既知の変異に対してスクリーニングを行い、未知の変異を発見します。
• ロングリードにより、アンプリコン全長に対して複数の変異を検出することが可能なため、ハプロタイプの識別が可能です。
• 低頻度の変異を検出することが可能です。
• 変異GUIビューで、アラインメント、位置の違いおよび頻度（%）を色分けして視覚的に示します。
• フレキシブルなプロジェクト構築: MIDタグ（バーコード）に基づくサンプル別に結果を分離、データのプロジェクトへのダイレクトなインポート、またフィルタリング/モディファイしたデータファイルの使用も可能です。
• データ出力: .ace（ コンティグ配列の各リードのアラインメント情報）、.png（グラフィック ファイル形式、タブで区切られたテキストファイル）